يعد قسم القسطرة القلبية من الأقسام الحيوية في مستشفى الاستقلال حيث أنه يقدم خدمات طبية بتقنية عالية من حيث التشخيص و العلاج لمعظم حالات تصلب الشرايين التاجية و كذلك تشخيص و علاج أمراض الأوعية الدموية و تشمل شرايين الدماغ والأطراف السفلية والأوردة. علاوة على ذلك, يقوم قسم القسطرة القلبية بإجراء دراسة كهربائية القلب وكي بؤر التسارع إن وجدت و حالات زرع أجهزة منظمة لضربات القلب بكافة أنواعه